Le CISSS de Lanaudière compte trois fondations qui ont pour mission de promouvoir, d'améliorer et de contribuer à la santé et au bien-être de la population lanaudoise : 

• Fondation pour la Santé du Nord de Lanaudière (installations du nord de Lanaudière, incluant les centres de réadaptation en déficience intellectuelle et en trouble du spectre de l'autisme [La Myriade] et les centres de réadaptation en déficience physique [Le Bouclier])
• Fondation Santé Sud de Lanaudière (installations du sud de Lanaudière)
• La Fondation Claude-Édouard Hétu (centres de protection de l’enfance et de la jeunesse)

Par le biais d'activités-bénéfice de même que des campagnes de financement, ces fondations contribuent à améliorer l’offre de service de l'établissement. En recueillant des dons permettant l’achat d’équipements  et la réalisation de projets rassembleurs, elles œuvrent ainsi de façon complémentaire au financement public.